İnşaat mühendisi Michael Scofield, ağabeyi Lincoln Burrows'un işlemediği bir suçtan dolayı idam cezasına çarptırıldığını bilir. Yasal yollar tükenince, Michael dahiyane bir plan yapar: Kendi tasarladığı hapishanenin (Fox River) planlarını vücuduna dövme olarak yaptırır.
Sahte bir banka soygunuyla kendini aynı hapishaneye attırır. İçeride, kaçış planını uygulamak için azılı suçlularla ittifak kurmak, hapishane hiyerarşisinde hayatta kalmak ve dışarıdaki büyük komployu çözmek zorundadır. Zaman daralmaktadır ve idam günü yaklaşmaktadır.
Zeka, mühendislik ve kardeş sevgisinin sınırlarını zorlayan bir gerilim.